肝细胞癌中差异表达EST的生物信息学分析和功能预测

• 作者: 孙嫣 孙艳 曾艳丽 朱武凌 李建生 李玉龙 段芳龄 陈香宇 韩泽广
• 来源期刊: 胃肠病学和肝病学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 生物信息学 表达序列标签 肝细胞癌
• 年，卷（期）: 2004,（1）
• 所属期刊栏目: 临床研究
• 页码范围: 43-48
• 页数: 6页
• 分类号: R730.261
• 字数: 4809字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1006-5709.2004.01.012

摘要

目的采用生物信息学方法分析、预测在原发性肝细胞癌中差异表达表达序列标签(expression sequence tag,EST)的全长、ORF、电子表达谱、染色体定位和编码蛋白质的功能,指导实验研究.方法应用多种生物学软件进行分析.结果获得两条新基因的全长序列,和RACE方法、测序获得的结果一致;两条EST分别定位于2p13～15、3p14;高表达EST主要表达于肿瘤组织,低表达EST主要表达于正常组织;高表达基因所编码蛋白质参与细胞信号转导、前mRNA加工和细胞骨架组装,低表达编码蛋白质和机体T淋巴细胞介导的免疫反应有关.结论采用生物信息学技术有助于高效、快速地克隆、鉴定新基因.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李建生	郑州大学第一附属医院消化内科	182	886	14.0	19.0
2	韩泽广		48	236	7.0	13.0
3	朱武凌	新乡医学院病理科	30	176	5.0	12.0