基因表达谱芯片筛选NS5ATP2剪切体NS5ATP2-512转染细胞差异表达基因

• 作者: 刘妍 张树林 成军 杨倩 白桂芹 蔺淑梅 黄燕萍
• 来源期刊: 胃肠病学和肝病学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 丙型肝炎病毒 剪切体 基因芯片
• 年，卷（期）: 2005,（4）
• 所属期刊栏目: 基础研究
• 页码范围: 331-335
• 页数: 5页
• 分类号: R373.2
• 字数: 4619字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1006-5709.2005.04.002

摘要

目的应用基因芯片技术检测丙型肝炎病毒(HCV)非结构蛋白5A(NS5A)反式激活基因NS5ATP2剪切体512的表达对肝母细胞瘤细胞HepG2基因表达谱的影响,进一步阐明NS5ATP2剪切体512蛋白可能的分子生物学功能.方法设计并合成NS5ATP2基因序列特异性的引物,应用聚合酶链反应(PCR)技术扩增NS5ATP2蛋白编码基因片段,以常规的分子生物学技术将获得的NS5ATP2编码基因片段克隆到TA载体中进行核苷酸序列的测定,在此过程中发现其剪切体NS5ATP2-512并构建真核表达载体pcDNA3.1(-)-NS5ATP2-512.以脂质体转染肝母细胞瘤细胞系HepG2,提取mRNA,逆转录为cDNA,与转染空白表达载体pcDNA3.1(-)的HepG2细胞进行cDNA芯片分析.结果构建的表达载体经过限制性内切酶分析和DNA序列测定,证实准确无误.提取高质量的mRNA,逆转录为cDNA,进行DNA芯片技术分析.在1 152个基因表达谱的筛选中,发现有14个基因表达水平显著上调,15个基因表达水平显著下调.结论应用基因表达谱芯片技术成功筛选了NS5ATP2剪切体NS5ATP2-512转染细胞后差异表达基因,为进一步阐明NS5ATP2-512蛋白可能的生物学功能提供依据.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	蔺淑梅	西安交通大学第一医院妇产科	44	96	4.0	7.0
2	杨倩	西安交通大学第一医院妇产科	21	119	7.0	10.0
3	张树林	西安交通大学第一医院妇产科	76	619	13.0	23.0
4	黄燕萍	西安交通大学第一医院妇产科	60	237	9.0	11.0
5	白桂芹	西安交通大学第一医院妇产科	36	148	6.0	10.0
6	成军	西安交通大学第一医院妇产科	1	0	0.0	0.0
7	刘妍	西安交通大学第一医院妇产科	2	14	1.0	2.0