基于伪氨基酸和支持向量机的蛋白质亚细胞定位预测

• 作者: 姜小莹 李晓波
• 来源期刊: 广西农业生物科学
• 学科: 工学
• 关键词: 生物信息 亚细胞定位 支持向量机 伪氨基酸 电子-离子伪势能
• 年，卷（期）: 2006,（4）
• 所属期刊栏目: 技术与方法
• 页码范围: 349-352,374
• 页数: 5页
• 分类号: Q617|TB114
• 字数: 2663字
• 语种: 中文

摘要

用电子-离子伪势能(EIIP)对蛋白质序列数字化,经离散傅立叶变换(DFT)后,取5个最高幅值对应的频率和20种氨基酸在序列中所占的百分比组成伪氨基酸.用支持向量机(SVM)方法得到分类的模型,并用几个标准的测试方法测试模型的性能.自身一致性测试和Jackknife测试均取得高的预测准确率,独立数据集测试的准确率超过80%.和之前报道的方法相比,本方法具有较高的预测准确率.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	姜小莹	河南科技学院化工系	36	141	7.0	10.0
2	李晓波	河南科技学院化工系	32	137	7.0	10.0