基于氨基酸约化和统计特征的蛋白质亚细胞定位预测

• 作者: 严寿江 姚玉华 徐慧敏 杨红 耿丽丽 陈静
• 来源期刊: 生物信息学
• 学科: 生物学
• 关键词: 蛋白质亚细胞定位 氨基酸物化性质 支持向量机
• 年，卷（期）: 2015,（2）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 103-110
• 页数: 8页
• 分类号: Q811
• 字数: 5036字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1672-5565.2015.02.05

摘要

蛋白质亚细胞定位预测对蛋白质的功能、相互作用及调控机制的研究具有重要意义。本文基于物化性质和结构性质对氨基酸的约化，描述序列局部和全局信息的“组成”、“转换”和“分布”特征，并利用氨基酸亲疏水性的数值统计特征，提出了一种新的蛋白质特征表示方法（ NSBH）。分别使用三种分类器KNN、SVM及BP神经网络进行蛋白质亚细胞定位预测，比较了几种方法和特征融合方法的预测结果，显示融合特征表示及结合SVM分类器时能够达到更好的预测准确率。同时，还详细讨论了不同参数对实验结果的影响，具体的实验及比较结果显示了该方法的有效性。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陈静	浙江理工大学生命科学学院	14	17	3.0	3.0
2	杨红		5	5	1.0	2.0
6	徐慧敏	浙江理工大学生命科学学院	1	5	1.0	1.0
7	严寿江	浙江理工大学生命科学学院	1	5	1.0	1.0
8	耿丽丽	浙江理工大学生命科学学院	1	5	1.0	1.0
9	姚玉华	浙江理工大学生命科学学院	7	18	3.0	4.0