基于序列信息理论预测线虫基因选择性剪切位点

• 作者: 李前忠 杨乌日吐 杨科利 林昊
• 来源期刊: 内蒙古大学学报(自然科学版)
• 学科: 生物学
• 关键词: 选择性剪切 供体位点 受体位点 支持向量机
• 年，卷（期）: 2008,（1）
• 页码范围: 45-49
• 页数: 5页
• 分类号: Q61
• 字数: 3428字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-1638.2008.01.009

摘要

基因的选择性剪切使得在DNA上一段相同的序列翻译成多个不同的蛋白质序列.选择性剪切的出现把剪切位点分为选择性供体位点、组成性供体位点、选择性受体位点和组成性受体位点.基于EBI中的线虫基因选择性剪切位点数据库,选取不同位点的单碱基频率和序列片段的三联体频数作为参数,利用位置权重矩阵和离散增量结合支持向量机,对选择性剪切位点进行了理论预测.对选择性供体位点和选择性受体位点的预测成功率分别为63.78%和72.63%,特异性分别为68.02%和83.96%.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	杨乌日吐	内蒙古大学理工学院物理系	8	18	3.0	4.0
2	李前忠	内蒙古大学理工学院物理系	87	366	11.0	15.0
3	林昊	内蒙古大学理工学院物理系	14	79	4.0	8.0
4	杨科利	内蒙古大学理工学院物理系	7	55	3.0	7.0