基于MATLAB的隐马尔可夫模型识别CpG岛

• 作者: 杨晶 田心 石鸥燕
• 来源期刊: 计算机应用与软件
• 学科: 工学
• 关键词: 马尔可夫链 隐马尔可夫模型 CpG岛 MATLAB
• 年，卷（期）: 2008,（11）
• 所属期刊栏目: 人工智能与识别
• 页码范围: 214-215,231
• 页数: 3页
• 分类号: TP3
• 字数: 1977字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-386X.2008.11.079

摘要

随着多数生物基因组测序工作的完成,基因识别就显得尤为重要.CpG岛在基因组中有着重要的生物学意义,而识别CpG岛将有助于基因的识别.因此构建了识别DNA序列中CpG岛的隐马尔可夫模型HMM(Hidden Markov Model),并利用网上人类基因CpG岛数据库中随机选取的94条基因序列数据对该模型进行训练与检测,得到了很高的预测准确率,结果表明HMM用于CpG岛的识别是快速有效的.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	田心	天津医科大学生物医学工程系	83	522	10.0	18.0
2	杨晶	天津医科大学生物医学工程系	34	217	8.0	13.0
3	石鸥燕	天津医科大学生物医学工程系	18	48	4.0	5.0