基于HMLP参数的二肽logP值支持向量机预测模型

• 作者: 印家健 李梦龙
• 来源期刊: 计算机与应用化学
• 学科: 化学
• 关键词: HMLP参数 肽 logP值 定量结构活性关系 支持向量机
• 年，卷（期）: 2008,（3）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 265-268
• 页数: 4页
• 分类号: O64|R14
• 字数: 3441字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1001-4160.2008.03.003

摘要

肽的亲(疏)水性在生物活性肽的合理设计和药物发现中是非常重要的参数.基于表征氨基酸性质的HMLP参数,分别用直接替代法和加和替代法表征肽段的结构信息,采用留一法交叉检验,利用支持向量回归(SVR)构建了36个二肽辛醇-水分配系数(logP)的预测模型(ε=0.001,σ=7.5,C=200和ε=0.001,σ=10,C=200),结果表明加和替代法要好于直接替代法,且其留一法交叉检验的复相关系为0.8768,其预测结果与实验值一致.但二者都说明了logP主要与肽的分子表面积和亲水指标有关,同时说明HMLP参数能够较好地表征氨基酸或肽链的结构信息.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李梦龙	四川大学化学学院	79	604	14.0	20.0
2	印家健	四川大学化学学院	8	43	4.0	6.0