粉尘螨变应原第7组分全长基因序列测定与分析

• 作者: 周鹰 孙炜 崔玉宝 彭江龙 王颖 赵丹
• 来源期刊: 现代生物医学进展
• 学科: 生物学
• 关键词: 尘螨 变应原 基因克隆 生物信息学
• 年，卷（期）: 2009,（16）
• 所属期刊栏目: 基础研究
• 页码范围: 3014-3019
• 分类号: Q78
• 语种: 中文

摘要

目的:获得粉尘螨变应原第7组分编码基因并了解其分子特征.方法:根据GenBank已公布的Der f7核酸序列设计引物,用RT-PCR扩增获得其编码基因,插入pMD19-T载体进行序列测定和生物信息学分析.结果:获得Der f7全长基因约642 bp,与参考序列(GenBank AY 283292)同源性达99.7%%,仅在249位"A→G"和439位"C→T"发生点突变,含1个完整的开放读码框.推测编码蛋白由213个氨基酸组成,信号肽序列位于1-17aa,亲水性指数为0.031,跨膜区域位于171-190aa,二级结构由-螺旋(57.28%)、延伸主链(6.57%)和无规卷曲(36.15%)组成;亚细胞定位于细胞质,含有N-糖基化位点1个(151-154aa),蛋白激酶C磷酸化位点1个(193-195aa),酪蛋白激酶Ⅱ磷酸化位点2个(155-158aa and 173-176aa),N端酰基化位点1个(97-102aa).粉尘螨和屋尘螨变应原第7组分氨基酸序列相似度为86%,二者在螨类第7组分氨基酸序列构建出的分子进化树中聚成一簇.结论:获得了Der f7全长基因,为进一步获得其基因工程制品用于临床和实验研究奠定了基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	孙炜	盐城卫生职业技术学院病原生物学教研室	27	43	4.0	5.0
2	彭江龙	海南医学院海南省热带病重点实验室	28	93	6.0	8.0
3	周鹰	盐城卫生职业技术学院病原生物学教研室	33	73	4.0	7.0
4	赵丹	黑龙江省齐齐哈尔医学院病原生物学教研室	69	193	7.0	12.0
5	王颖	海南医学院海南省热带病重点实验室	17	33	3.0	5.0