黄冠梨几丁质酶基因家族cDNA全长序列克隆与分析

• 作者: 刘栋峰 张朝红 王跃进
• 来源期刊: 农业生物技术学报
• 学科: 农学
• 关键词: 梨 几丁质酶 基因家族 克隆 RACE
• 年，卷（期）: 2009,（6）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 1042-1049
• 页数: 8页
• 分类号: S188
• 字数: 5553字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1674-7968.2009.06.016

摘要

根据已知植物几丁质酶基因序列的保守区域,设计特异性引物,以梨黄冠(Pyrus hybrid c v.Huangguan)品种叶片为材料,提取RNA,进行反转录,克隆获得5个几丁质酶基因cDNA片段,进一步通过RACE技术获得该基因的全长cDNA序列,依次命名为PyChi1、PyChi2、PyChi3、PyChi4和PyChi5,序列提交GenBanK,登录号为FJ589783、FJ589784、FJ589785、FJ589786和FJ589787.序列分析结果表明,所获得5个几丁质酶基因,都具有完整的ORF和Poly(A)结构,与其它植物几丁质酶基因具有较高的相似性;5个基因的核酸序列的同源性约在35%～53%之间,PyChi1和PyChi4的氨基酸同源性最高,约85%,而与PyChi5约77%;在几丁质酶基因家族分别属于Chitinase Classes Ⅰ～Ⅴ,为5个不同类型的成员;不同类型的几丁质酶基因在核酸和氨基酸序列以及功能结构方面都存在着显著的差异,主要表现在肽链特性和基因结构等方面.