长雄野生稻地下茎cDNA文库的构建及EST分析

• 作者: 孔华 林海妹 王晓玲 贺立卡 郭安平 郭运玲
• 来源期刊: 热带作物学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 长雄野生稻 地下茎 cDNA文库
• 年，卷（期）: 2009,（5）
• 所属期刊栏目: 生物技术应用及组织培养
• 页码范围: 683-687
• 页数: 5页
• 分类号: Q78
• 字数: 3594字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-2561.2009.05.023

摘要

长雄野生稻(Oryza longisatminata)是广泛生长在热带非洲的1个野生种,具有明显的地下茎特征.为了探索控制其地下茎发育的相关基因及其他优异基因,初步构建了地下茎cDNA文库.文库指标显示:初始滴度为2.5×105cfu/μg,扩增滴度为2.9x108cfu/μg,库容为5x106cfu,重组率为82%;随机挑选80个单克隆进行测序,插入片段在400～1 000bp之间;对测序结果进行比对分析,获得了58个已报道有一定功能的EST序列,22个未见报道的EST序列;并利用PAUP4.0软件对序列进行了筛选分析.