光皮桦茎叶cDNA文库构建及部分EST序列SSR分析

• 作者: 周厚君 张敏 林二培 王亚辉 童再康 黄华宏
• 来源期刊: 北京林业大学学报
• 学科: 农学
• 关键词: 光皮桦 cDNA文库 SSR分析
• 年，卷（期）: 2012,（4）
• 所属期刊栏目: 林学
• 页码范围: 58-61
• 分类号: S718.46
• 语种: 中文

摘要

以光皮桦茎叶组织为材料,构建了cDNA文库。初级文库滴度为1.5×106pfu/mL,重组率达97.3%,插入片段大小在0.5～3.0kb之间,平均长度约为1.3kb,表明所构建的文库质量较高,可用于后续基因克隆及基因表达谱的研究。利用微卫星查找软件对获得的224条EST序列进行微卫星位点搜寻及其丰度、分布比较,发现47条序列含微卫星位点60个,占全部EST序列的26.80%;在所有SSRs中二碱基重复最多,为42个,占总数的70.00%,含三、四碱基重复分别占总数的28.30%和1.70%。通过对光皮桦EST序列中微卫星位点信息的发掘分析,为有针对性地设计EST-SSR引物、进行遗传多样性分析奠定了基础。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	童再康	浙江农林大学林业与生物技术学院	36	168	6.0	11.0
2	黄华宏	浙江农林大学林业与生物技术学院	21	83	6.0	7.0
3	林二培	浙江农林大学林业与生物技术学院	15	60	6.0	7.0
4	张敏	浙江农林大学林业与生物技术学院	9	42	5.0	6.0
5	周厚君	浙江农林大学林业与生物技术学院	4	23	3.0	4.0
6	王亚辉	浙江农林大学林业与生物技术学院	2	13	2.0	2.0