木榄幼苗叶片cDNA文库的构建及其表达序列标签分析

• 作者: 叶波平 吴梧桐 周峰 孙伟 管悦 许媛媛 高向东
• 来源期刊: 热带亚热带植物学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 木榄 叶 cDNA文库 EST序列 功能分析
• 年，卷（期）: 2010,（2）
• 所属期刊栏目: 植物生理与分子生物学
• 页码范围: 140-150
• 页数: 11页
• 分类号: Q785
• 字数: 7010字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1005-3395.2010.02.006

摘要

应用SMART技术构建了25‰盐度下生长4个月的木榄叶片的cDNA文库,文库滴度为10~6 cfu mL~(-1),重组率为94.4%,插入片断长度为1～2 kb.从cDNA文库中随机挑选了96个重组克隆进行序列分析,共获得94个表达序列标签(ESTs),经质量控制和聚类拼接后得到81个unigenes,包括5个片断聚合群和76个单一序列.Blastx分析结果表明这些unigencs与GenBank的Nr数据库中已报道的基因具有较高的同源性(E<10~(-5)),它们参与呼吸代谢、光合作用、糖代谢、氨基酸代谢、脂肪酸代谢以及不饱和脂肪酸生物合成等重要的生理过程,并与机体的损伤修复、胞吞作用以及PPAR信号途径等相关.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	吴梧桐	中国药科大学生命科学与技术学院	256	2771	24.0	37.0
2	叶波平	中国药科大学生命科学与技术学院	105	1007	17.0	27.0
3	高向东	中国药科大学生命科学与技术学院	188	1604	21.0	30.0
4	孙伟	中国药科大学生命科学与技术学院	8	89	3.0	8.0
5	管悦	中国药科大学生命科学与技术学院	3	4	1.0	2.0
6	许媛媛	中国药科大学生命科学与技术学院	3	4	1.0	2.0
7	周峰	中国药科大学生命科学与技术学院	3	4	1.0	2.0