葡萄NAC转录因子家族生物信息学分析

• 作者: 上官凌飞 孙欣 宋长年 慕茜 房经贵 王晨
• 来源期刊: 基因组学与应用生物学
• 学科: 生物学
• 关键词: 葡萄 拟南芥 NAC转录因子 生物信息学
• 年，卷（期）: 2011,（2）
• 所属期刊栏目: 数据分析
• 页码范围: 229-242
• 分类号: Q811.4
• 字数: 3617字
• 语种: 中文

摘要

NAC基因家族是植物所特有的一类重要转录因子,广泛参与植物生长、发育以及器官建成、逆境胁迫应答等反应。目前,基因组信息的挖掘和分析已经成为葡萄功能基因组学研究的重要组成部分。本文利用生物信息学方法对葡萄143条NAC蛋白序列的系统发生和NAC基因组定位进行分析,然后对其氨基酸组成成分、理化性质以及二级和三级结构进行预测和分析,同时还分析了葡萄与拟南芥的NAC基因家族之间的联系。结果显示这143条蛋白序列与拟南芥94个NAC基因蛋白序列一起分成了16个亚族,说明拟南芥与葡萄NAC基因间具有较高的保守性。基因组定位结果发现143条NAC基因分布在17条染色体上。研究还发现不同亚家族间氨基酸数目、氨基酸序列间的疏水性存在一定的差异;而它们的二级结构都主要以随机卷曲为组成部分,且143条氨基酸序列三维结构十分相似。本文试验结果将为葡萄NAC基因家族的进一步功能分析提供重要研究基础。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	上官凌飞	南京农业大学园艺学院	37	426	13.0	20.0
2	房经贵	南京农业大学园艺学院	194	3087	29.0	47.0
3	宋长年	南京农业大学园艺学院	40	502	16.0	21.0
4	王晨	南京农业大学园艺学院	69	628	15.0	22.0
5	孙欣	南京农业大学园艺学院	17	181	10.0	13.0
6	慕茜	南京农业大学园艺学院	14	165	9.0	12.0