基于EST和GSS序列的玉米未知微RNA的数据挖掘

• 作者: 李婧 熊莉丽 胡久梅 郭志云
• 来源期刊: 生物技术通报
• 学科: 农学
• 关键词: MicroRNA 玉米 EST GSS 靶基因
• 年，卷（期）: 2011,（12）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 108-112
• 分类号: S513
• 字数: 2557字
• 语种: 中文

摘要

miRNAs通过与靶基因互补位点配对结合,在转录后水平负性调控靶基因的表达.根据miRNA进化上的保守性,以拟南芥、水稻等已知的植物miRNAs为探针,与相关数据库中玉米表达序列标签(EST)和基因组序列(GSS)中的非编码序列比对,采用一系列的标准进行筛选,最后预测得到24个玉米miRNA前体,通过靶基因的预测共得到61个靶基因.通过生物信息学方法大大提高了人们发现miRNAs及其靶基因的效率,补充了玉米miRNA数据库的不足.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李婧	西南交通大学生命科学与工程学院	20	54	4.0	7.0
2	郭志云	西南交通大学生命科学与工程学院	14	41	4.0	6.0
3	熊莉丽	西南交通大学生命科学与工程学院	12	60	5.0	7.0
4	胡久梅	西南交通大学生命科学与工程学院	20	117	6.0	10.0