不同物种TYRP2基因完整编码区生物信息学分析

• 作者: 刘伟兰 周荣艳 李兰会 李祥龙 杨清芳
• 来源期刊: 河南农业科学
• 学科: 生物学
• 关键词: TYRP2基因 遗传多样性 系统发育 多肽信息 动物毛色
• 年，卷（期）: 2011,（10）
• 所属期刊栏目: 畜牧·兽医
• 页码范围: 144-148
• 分类号: Q78
• 字数: 4147字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1004-3268.2011.10.041

摘要

应用生物信息学和比较基因组学方法,比较分析了人、毛猩猩、绵羊、牛、猪、马、犬、斑马鱼、大熊猫、小家鼠、褐家鼠、鸭嘴兽、非洲爪蟾、原鸡、绿头鸭、斑胸草雀、黑猩猩、恒河猕猴、狨、灰短尾负鼠和兔21个物种T YR P2基因完整编码区(CDS),并对其遗传多样性、分子系统发育、编码蛋白的氨基酸序列、信号肽、跨膜结构域、疏水性/亲水性、二级结构等进行了预测.结果表明,从21个物种的42条基因序列检测到741个多态位点,共生成26种单倍型.物种间TYRP2基因序列编码区存在较丰富的遗传多样性,物种内该基因序列编码区则存在较强的保守性.TYRP2基因密码子有较强的偏爱性.根据核苷酸歧异度和遗传分化系数对物种的亲缘关系进行分析,结果表明,人与黑猩猩亲缘关系最近,小家鼠和褐家鼠亲缘关系最近.TYRP2基因多肽存在信号肽,有跨膜结构域,表现为疏水性,二级结构的主要组成元件为无规卷曲和a螺旋.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李兰会	河北农业大学动物科技学院	120	583	13.0	17.0
2	李祥龙	河北农业大学动物科技学院	65	311	9.0	14.0
3	周荣艳	河北农业大学动物科技学院	105	307	9.0	11.0
4	杨清芳	河北农业大学动物科技学院	2	21	2.0	2.0
5	刘伟兰	河北农业大学动物科技学院	3	8	1.0	2.0