糜子miRNAs的生物信息学预测及实验验证

• 作者: 单卫星 方晓峰 杜江峰 梁宗锁 武永军 王晓龙
• 来源期刊: 中国科学（生命科学）
• 关键词: microRNA 糜子 预测 验证 靶标
• 年，卷（期）: 2012,（9）
• 所属期刊栏目: 论文
• 页码范围: 757-767
• 页数: 11页
• 语种: 中文

摘要

microRNA是一类在转录后调控中发挥重要作用的非编码小RNA,其靶标参与高等植物的发育、代谢、胁迫应答等生物学过程.糜子是一类重要的禾谷类作物,但目前还未见与其相关的miRNA报道.通过基于表达序列标签和miRNA前体二级结构的同源搜索,鉴定到43个新的miRNAs.这些miRNAs不均匀地分布于11个miRNA家族.利用psRNAtarget对这些miRNAs分析表明,它们调控68个靶标基因.11个miRNAs家族中的10个参与了RNA调控,表明了它们在糜子转录后调控中的基本作用.利用Northern blot对8个家族的miRNAs进行了鉴定,表明本实验的预测方法是有效的.