杜仲EuHMGRS基因家族的鉴定及生物信息学分析

• 作者: 乌云塔娜 叶生晶 王淋
• 来源期刊: 经济林研究
• 学科: 农学
• 关键词: 杜仲 萜类物质 基因家族 3-羟基-3-甲基戊二酰辅酶A
• 年，卷（期）: 2013,（4）
• 所属期刊栏目: 杜仲研究专栏
• 页码范围: 16-24
• 分类号: S603.2
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1003-8981.2013.04.003

摘要

萜类物质合成关键酶3-羟基-3-甲基戊二酰辅酶A还原酶(HMGRS)是甲羟戊酸途径(mevalonate pathway,MVA)的第1个限速酶,对萜类物质的合成具有重要的作用.为了探明EuHMGRS家族基因对杜仲萜类物质合成的调控机制,对EuHMGRS家族基因进行生物信息学分析,结果表明:杜仲EuHMGRS基因中存在HMGRS特有的保守的活性位点,其中包括2个HMG-CoA结合位点(EMPVGYVQIP、TTEGCLVA)和2个NADP (H)结合位点(DAMGMNM、GTVGGGT),因此可以确定为杜仲HMGRS基因家族,在杜仲中该家族成员至少包含3个基因,记为EuHMGR 12、EuHMGR 18、EuHMGR19.杜仲HMGRS与其它植物的HMGRS蛋白相比在中间区域和C端保守性高,在N端的序列相似性较低,预示不同的HMGRS基因功能上具有高度的保守性,但是对于在亚细胞定位可能会具有多样性.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	乌云塔娜	中国林业科学研究院经济林研究开发中心	25	112	6.0	8.0
5	王淋	中南林业科技大学经济林育种与栽培国家林业局重点实验室	9	46	4.0	6.0
9	叶生晶		8	28	3.0	5.0