杜仲EuACOTS基因家族的鉴定及生物信息学分析

• 作者: 乌云塔娜 叶生晶 王淋
• 来源期刊: 经济林研究
• 学科: 农学
• 关键词: 杜仲 乙酰CoA 酰基转移酶 生物信息学
• 年，卷（期）: 2013,（4）
• 所属期刊栏目: 杜仲研究专栏
• 页码范围: 1-8
• 分类号: S603.2
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1003-8981.2013.04.001

摘要

乙酰CoA酰基转移酶(acetylCoA Cacetyltransferase,ACOT)是萜类化合物生物合成甲羟戊酸(mevalonate pathway,MVA)途径的起始酶,为了揭示生物合成杜仲胶的机制,对杜仲ACOTS基因家族进行全面的生物信息学分析.EuACOTS家族含有3个基因,分别记为EuACOT8、EuACOT9、EuACOT10.对其氨基酸序列的理化性质、跨膜结构域、疏水性/亲水性以及同源进化等性质进行了分析,结果发现EuACOTS蛋白质的性质结构均较为相似,均存在2个硫解酶的特异保守序列,均属于稳定的疏水蛋白,无明显的跨膜区.在对EuACOTS基因家族启动子顺式作用元件潜在功能的预测分析中发现,EuACOTS基因家族启动子顺式作用元件进行比较发现启动子作用既有保守性,又有特异性,其中EuA CO TS家族含有大量基本顺式作用元件TATAbox,CAATbox以及光(AE-box、Box I、MNF1)、乙烯(ERE)、真菌诱导(Box-W1)和脱落酸(ABRE)等多个顺式调控元件.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	乌云塔娜	中国林业科学研究院经济林研究开发中心	25	112	6.0	8.0
5	王淋	中南林业科技大学经济林育种与栽培国家林业局重点实验室	9	46	4.0	6.0
9	叶生晶		8	28	3.0	5.0