黄绿蜜环菌SSR-PCR反应体系的优化及引物筛选

• 作者: 夏明哲 方慧 李颖 田飞 谢占玲 贾贤卿
• 来源期刊: 北方园艺
• 学科: 农学
• 关键词: 黄绿蜜环菌 SSR-PCR 体系优化 正交设计 引物
• 年，卷（期）: 2013,（16）
• 所属期刊栏目: 生物技术
• 页码范围: 114-119
• 分类号: S503.53
• 语种: 中文

摘要

以CTAB法提取的黄绿蜜环菌(Armillaria luteo-virens) DNA为模板,应用L16(45)正交实验设计,对Mg+、dNTPs、引物和Taq DNA聚合酶、模板浓度5种因素进行SSR-PCR反应体系优化,建立了适合黄绿蜜环菌SSR-PCR反应的最佳体系并对退火温度进行检测.结果表明:在15μL反应体系中包括:1×PCR Buffer,100 ng模板DNA,dNTPs 217ìmol/L,引物0.5 μmol/L,Taq DNA聚合酶0.75 U,Mg2+ 1.3 mmol/L.稳定性检测证明,该反应体系具有较高的稳定性和重复性,并从34对引物中共筛选出扩增条带清晰、多态性丰富的SSR引物8对.该体系的建立为今后利用SSR标记对黄绿蜜环菌遗传多样性研究、亲缘关系分析及种质资源鉴定等研究提供了依据.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	谢占玲	青海大学生态环境工程学院	33	414	9.0	20.0
3	夏明哲	青海大学生态环境工程学院	4	16	3.0	4.0
6	贾贤卿	青海大学生态环境工程学院	2	6	1.0	2.0
7	李颖	青海大学生态环境工程学院	1	5	1.0	1.0
8	田飞	青海大学生态环境工程学院	1	5	1.0	1.0
9	方慧	青海大学生态环境工程学院	1	5	1.0	1.0