miR-9在宫颈癌组织中的表达及其靶基因的预测和生物信息学分析

• 作者: 刘斐 张蔚 曾康康 胡晓霞 莫祥兰
• 来源期刊: 广西医学
• 学科: 医学
• 关键词: 宫颈癌 miR-9 靶基因 生物信息学
• 年，卷（期）: 2014,（3）
• 所属期刊栏目: 论著? 基础研究
• 页码范围: 273-276
• 页数: 4页
• 分类号: R737.33
• 字数: 3230字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11675/j.issn.0253-4304.2014.03.01

摘要

目的：探讨宫颈癌组织中miR-9表达，并对靶基因进行预测及生物信息学分析，为深入研究miR-9的调控机制及生物学功能提供理论依据。方法应用miRNAs芯片检测宫颈癌组织及正常宫颈组织中miRNAs表达，利用生物学软件对其中上调较明显的miR-9进行靶基因预测，同时利用基因芯片技术筛选转染miR-9后宫颈癌Hela细胞中差异表达的基因，将两者预测靶基因的交集作为miR-9的靶基因进行GO富集分析和生物通路富集分析。结果与正常宫颈组织比较，宫颈癌组织中有15个miRNAs表达为上调，10个miRNAs表达为下调，其中上调较明显的是miR-21和miR-9，下调较明显的是miR-376a和miR-218。芯片所示的miR-9调控的下调基因与软件预测的靶基因交集中共有148个基因，miR-9的预测靶基因富集在细胞内的生物学调控、合成和代谢等生物学过程以及转录调控和蛋白结合等分子功能上，其信号通路富集于调节肌动蛋白细胞骨架、脂质代谢和细胞黏附通路。结论 miR-9在宫颈癌组织中高表达，miR-9预测的靶基因富集于多个生物学功能和生物学过程及与肿瘤相关的信号通路。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	莫祥兰	广西壮族自治区人民医院病理科	95	349	9.0	12.0
2	张蔚	武汉大学人民医院妇科	164	1048	16.0	24.0
3	刘斐	广西壮族自治区人民医院科研试验中心	21	103	6.0	9.0
4	胡晓霞	广西壮族自治区人民医院妇科	41	223	8.0	13.0
5	曾康康	武汉大学人民医院妇科	4	88	3.0	4.0