巨桉AGO基因家族的生物信息学分析

• 作者: 刘英 曾炳山 李湘阳 王象军 范春节 裘珍飞 郭光生 闫慧芳
• 来源期刊: 热带亚热带植物学报
• 关键词: 桉树 AGO蛋白 基因家族 生物信息
• 年，卷（期）: 2015,（4）
• 所属期刊栏目: 植物生理与分子生物学
• 页码范围: 361-369
• 页数: 9页
• 字数: 5748字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11926/j.issn.1005-3395.2015.04.001

摘要

为了解巨桉(Eucalyptus grandis)中Argonaute (AGO)的功能，经全基因组序列分析，巨桉中存在14个AGO基因家族成员，基因长度为2676~3225 bp，编码的蛋白质具有保守的Piwi、PAZ、DUF1785结构域。巨桉EgrAGOs基因可分为3组，内含子和外显子结构具有明显的组织特异性。组内成员核苷酸序列和氨基酸序列保守性较高，同源性分别达到88.14%和82.97%。EgrAGO基因分布于第2、4、7、8、10、11条染色体上，在进化过程中存在着串联复制和大片段基因复制机制。预测巨桉的大部分AGO蛋白定位于细胞核和胞质中，表现出偏碱性和亲水性，具有较高的脂溶指数。基因表达分析表明，桉树EgrAGO成员在不同组织中的表达有明显差异，与木材形成相关的组织/器官中有较高的表达。这些为深入研究EgrAGO基因的功能奠定了基础。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	曾炳山	中国林业科学研究院热带林业研究所	75	586	12.0	22.0
2	刘英	中国林业科学研究院热带林业研究所	43	334	9.0	16.0
3	裘珍飞	中国林业科学研究院热带林业研究所	50	373	10.0	18.0
4	李湘阳	中国林业科学研究院热带林业研究所	28	195	7.0	13.0
5	范春节	中国林业科学研究院热带林业研究所	26	53	4.0	6.0
6	闫慧芳	中国林业科学研究院热带林业研究所	3	4	2.0	2.0
7	王象军	中国林业科学研究院热带林业研究所	2	4	2.0	2.0