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SYBR GreenI实时荧光定量PCR检测小麦纹枯病菌体系的建立和应用
SYBR GreenI实时荧光定量PCR检测小麦纹枯病菌体系的建立和应用
作者:
孙炳剑
施艳
李洪连
袁虹霞
陈清清
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
小麦纹枯病菌
SYBR Green I
实时荧光定量 PCR
早期检测
摘要:
【目的】纹枯病是小麦生产上重要的土传病害之一,早期准确定量检测病原是病害预测预报及实现有效防控的基础。传统组织分离鉴定方法费时、程序复杂,而且无法做到准确定量。为实现小麦纹枯病早期快速准确定量检测,研究旨在建立小麦纹枯病菌(Rhizoctonia cerealis)的 SYBR Green I 实时荧光定量 PCR(real-time PCR)检测方法。【方法】根据小麦纹枯病菌的β-tubilin 序列,设计1对特异性引物,建立并优化 SYBR Green I real-time PCR 反应体系,利用小麦纹枯病菌、立枯丝核菌(R. solani)、双核丝核菌 AG-A 和 AG-F 菌株、小麦全蚀病菌(Gaeumannomyces graminis var. tritici)、小麦根腐病菌(Bipolaris sorokiniana)、小麦茎基腐病菌假禾谷镰孢(Fusarium pseudograminearum)和禾谷镰孢(F. graminearum)等8种小麦根部或土壤病原物的菌丝 DNA 进行普通 PCR 和 real-time PCR 特异性检测,并对灵敏度、可重复性进行评价。利用该体系分别检测接种后5、10、60 d 不同接种浓度的盆栽小麦病株。【结果】研究设计的引物特异性强,普通 PCR 检测结果仅小麦纹枯病菌 DNA 有扩增条带。Real-time 检测结果表明该对引物对小麦纹枯病菌只有唯一的产物吸收峰,对其余供试菌株均未检测到荧光信号。普通 PCR 检测的灵敏度为6.5×103 copies/μL, real-time PCR 的灵敏度可达到6.5×102 copies/μL。以携带目的基因片段的重组质粒为标准品,构建的 real-time PCR 标准曲线循环阈值与模板浓度呈良好的线性关系,熔解曲线的吸收峰单一,相关系数为0.997,扩增效率为0.91。对人工接种的盆栽小麦病株进行 real-time PCR 检测,结果表明与病情指数和接种量分别呈显著正相关。【结论】研究建立的基于 real-time PCR 技术的小麦纹枯病菌快速检测方法速度快、灵敏度高、特异性强、重复性好。可以用于小麦纹枯病菌检测、指导病害预测和防治。
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文献信息
篇名
SYBR GreenI实时荧光定量PCR检测小麦纹枯病菌体系的建立和应用
来源期刊
中国农业科学
学科
关键词
小麦纹枯病菌
SYBR Green I
实时荧光定量 PCR
早期检测
年,卷(期)
2015,(1)
所属期刊栏目
植物保护
研究方向
页码范围
55-62
页数
8页
分类号
字数
语种
中文
DOI
10.3864/j.issn.0578-1752.2015.01.06
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
李洪连
河南农业大学植物保护学院
148
2274
27.0
40.0
传播情况
被引次数趋势
(/次)
(/年)
引文网络
引文网络
二级参考文献
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共引文献
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参考文献
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研究来源
研究分支
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中国农业科学
主办单位:
中国农业科学院
出版周期:
半月刊
ISSN:
0578-1752
CN:
11-1328/S
开本:
大16开
出版地:
北京中关村南大街12号
邮发代号:
2-138
创刊时间:
1960
语种:
chi
出版文献量(篇)
9193
总下载数(次)
12
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