大麦SERK基因家族cDNA克隆及生物信息学分析

• 作者: 何婷 刘成洪 李颖波 杨沙沙 谭何新 郭桂梅 陈志伟 黄剑华
• 来源期刊: 上海农业学报
• 学科: 农学
• 关键词: 大麦 SERK 注释 克隆 生物信息学分析
• 年，卷（期）: 2016,（3）
• 所属期刊栏目: 遗传育种·分子遗传学
• 页码范围: 5-13
• 页数: 9页
• 分类号: S512.3
• 字数: 5069字
• 语种: 中文
• DOI: 10.15955/j.issn1000-3924.2016.03.02

摘要

通过对大麦体细胞胚胎发生受体类蛋白激酶SERK(Somatic embryogenesis receptor-like kinases)基因家族进行注释和基因克隆,得到3条大麦序列,即HvSERK1、HvSERK2和HvSERK3,其中基因HvSERK3与相应已有参考序列(Accession:AK374641)相比,编码氨基酸有所改变.生物信息学分析表明:3条大麦SERK基因都具有1 870 bp左右的开放阅读框,620 aa左右的氨基酸残基数,69 kD左右的相对分子质量大小,平均理论等电点5.5,说明SERK为酸性蛋白;大麦SERK蛋白具有强烈的亲水性,且存在N端信号肽和跨膜螺旋区,二级结构组件主要是环(loop).本研究为进一步探讨大麦中SERK基因家族的功能奠定了基础.