大豆基因组中OSCA基因家族的进化和表达分析

• 作者: 刘瑀 孙明哲 孙晓丽 李建伟 杨臖凯 殷奎德 贾博为
• 来源期刊: 中国油料作物学报
• 学科: 农学
• 关键词: 大豆 OSCA 家族分析 表达分析
• 年，卷（期）: 2017,（5）
• 所属期刊栏目: 遗传育种
• 页码范围: 589-599
• 页数: 11页
• 分类号: S565.1
• 字数: 7303字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7505/j.issn.1007-9084.2017.05.002

摘要

OSCA是钙通透性阳离子通道蛋白,在高渗胁迫感应中发挥重要的作用.本研究利用生物信息,筛选并鉴定出21个大豆OSCA家族成员.通过染色体定位及同源性分析表明,OSCA家族成员分布在15条染色体上,且存在大量的复制现象;通过Ka/Ks分析表明大豆OSCA家族基因的进化经受纯化选择压力.通过构建系统进化树,将大豆OSCA家族分为2个亚家族,第一亚家族又分为三组(GroupⅠ~Ⅲ),且各组内成员具有相似的内含子-外显子组成模式.保守性分析结果表明,大豆OSCA基因家族很保守,都包含3个功能结构域(即Late exocyto-sis,Cytosolic domain of 10TM putative phosphate transporter和Calcium-dependent channel);进一步组织表达分析结果表明,OSCA基因家族在不同组织的表达量不同.盐碱胁迫表达模式分析表明,OSCA3.1上调表达变化倍数最大.进一步的启动子分析结果表明,这些盐碱胁迫应答的基因启动子中存在着多种不同的胁迫响应元件,其中干旱和ABA应答相关的元件较多.以上结果为OSCA基因家族提供了新的有价值的信息,并为后续研究提供了重要参考.