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皱纹盘鲍亮氨酸氨肽酶基因cDNA克隆及表达分析
皱纹盘鲍亮氨酸氨肽酶基因cDNA克隆及表达分析
作者:
刘光明
张凌晶
曹敏杰
李越
段雪昆
胡健健
陈玉磊
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
皱纹盘鲍
亮氨酸氨肽酶
cDNA克隆
生物信息学
摘要:
利用PCR和RACE技术从皱纹盘鲍(Haliotis discus hannai)肌肉中克隆亮氨酸氨肽酶基因cDNA序列,并对其结构进行分析.皱纹盘鲍亮氨酸氨肽酶(Haliotis discus hannai leucine aminopeptidase,Hdh-LAP)cDNA全长共3251 bp,包含5′非编码区(5′UTR)56 bp,3′非编码区(3′UTR)651 bp,开放阅读框(open reading frame,ORF)2544 bp,共编码847个氨基酸残基.多序列比对结果显示,该氨基酸序列与太平洋牡蛎(Crassostrea gigas)、 霸王莲花青螺(Lottia gigantea)、 囊舌虫(Saccoglossus kowalevskii)的亮氨酸氨肽酶序列相似性分别为85%、68%和61%.预测Hdh-LAP基因编码蛋白质的相对分子质量为95.09 ku,理论等电点为5.16.Hdh-LAP蛋白质的二级结构以α-螺旋和无规则卷曲为主,其中α-螺旋占38.02%,无规则卷曲占30.11%,β-折叠占22.43%,β-转角占9.45%.Hdh-LAP主要分布在细胞质(59.2%)、 线粒体(10.0%)和溶酶体(10%)中,推测其可能在能量代谢和辅因子的生物合成过程中发挥信号转导和转录因子调控的作用.系统发育关系分析结果显示,Hdh-LAP与牡蛎亮氨酸氨肽酶关系最近.荧光定量PCR结果表明,Hdh-LAP基因在鲍肌肉、 肝胰腺、 性腺、 血淋巴细胞、 腮、 外套膜等6个组织中均有表达,在血淋巴细胞中表达量最高,肌肉次之,性腺最少.
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皱纹盘鲍
鲍防御素(hd-def)
cDNA
基因组
基因表达
内容分析
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文献信息
篇名
皱纹盘鲍亮氨酸氨肽酶基因cDNA克隆及表达分析
来源期刊
集美大学学报(自然科学版)
学科
农学
关键词
皱纹盘鲍
亮氨酸氨肽酶
cDNA克隆
生物信息学
年,卷(期)
2017,(5)
所属期刊栏目
水产、食品与生物技术
研究方向
页码范围
31-39
页数
9页
分类号
Q785|S917.4
字数
6095字
语种
中文
DOI
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皱纹盘鲍
亮氨酸氨肽酶
cDNA克隆
生物信息学
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
集美大学学报(自然科学版)
主办单位:
集美大学
出版周期:
双月刊
ISSN:
1007-7405
CN:
35-1186/N
开本:
大16开
出版地:
福建厦门集美银江路185号
邮发代号:
创刊时间:
1996
语种:
chi
出版文献量(篇)
1788
总下载数(次)
5
总被引数(次)
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