微滴数字PCR(ddPCR)检测马铃薯S病毒(PVS)

• 作者: 付伟 周慧 张永江 朱鹏宇 李晓宇 王晨光 王溪桥 黄洁芳
• 来源期刊: 农业生物技术学报
• 学科: 农学
• 关键词: 马铃薯S病毒(PVS) 微滴数字PCR(ddPCR) 检测鉴定 特异性 灵敏度
• 年，卷（期）: 2017,（10）
• 所属期刊栏目: 研究资源与技术改进
• 页码范围: 1721-1728
• 页数: 8页
• 分类号: S41-30
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1674-7968.2017.10.019

摘要

马铃薯(Solanum tuberosum)为世界重要农作物之一,受马铃薯S病毒(Potato viruss,PVS)侵染会导致其品质下降,产量降低;灵敏准确的检测技术将有助于提高PVS的检出率,进而防止其传播扩散危害马铃薯生产,保护马铃薯产业发展.为了建立PVS灵敏准确的检测技术,本研究根据其外壳蛋白(coatprotein,CP)基因保守序列设计了微滴数字PCR(droplet digital PCR,ddPCR)的引物探针,并进行了特异性、灵敏度及重复性验证.结果表明,所建立的方法对PVS具有良好的特异性,能够有效区分对照病毒马铃薯X病毒(Potato virus X,PVX)、马铃薯Y病毒(Potato virus y,PVY)、黄瓜花叶病毒(Cucumber mosaic virus,CMV)和烟草花叶病毒(Tobacco mosaic virus,TMV),与传统qRT-PCR结果一致;检测灵敏度可达20拷贝/μL的RNA,比qRT-PCR灵敏度高10倍;3次重复实验微滴数的标准误差小于总微滴数的1.5％,表明所建立的ddPCR方法具有良好的重复性.本研究建立的ddPCR方法可用于PVS的准确检测,也为其他植物病毒的准确检测提供了借鉴.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张永江		74	381	10.0	15.0
2	周慧	海南出入境检验检疫局热带植物隔离中心	11	19	3.0	3.0
3	付伟		20	61	5.0	6.0
4	王晨光		6	16	3.0	4.0
5	朱鹏宇		8	27	3.0	5.0
6	王溪桥	甘肃出入境检验检疫局综合技术中心	13	13	2.0	3.0
7	李晓宇	甘肃出入境检验检疫局综合技术中心	1	3	1.0	1.0