草鱼呼肠孤病毒AH528株全基因组特征及进化分析

• 作者: 何吉祥 侯冠军 吴明林 李海洋 江河 蒋阳阳
• 来源期刊: 渔业科学进展
• 学科: 农学
• 关键词: 草鱼出血病 草鱼呼肠孤病毒 VP1蛋白 水生呼肠孤病毒
• 年，卷（期）: 2018,（5）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 36-43
• 页数: 8页
• 分类号: S941
• 字数: 5506字
• 语种: 中文
• DOI: 10.19663/j.issn2095-9869.20170712001

摘要

草鱼出血病是由草鱼呼肠孤病毒(Grass carp reovirus,GCRV)引起的严重危害1～2龄草鱼的一种传染性疾病.本研究从安徽合肥地区患典型草鱼出血病的病鱼组织中分离到1株新的GCRV致病株,暂命名为GCRV-AH528.鱼体人工感染实验结果显示,实验鱼出现典型的出血病症状:体背发黑,鳍基部、腹部、口腔、鳃丝、肠道充血发红.全基因组特征分析显示,GCRV-AH528由11个双链RNA节段组成,节段大小在1027～3925 bp之间,AT平均含量为50.2％,GC平均含量为49.8％.与其他GCRVⅡ型毒株相比,L1节段在701～702位置缺少3个核苷酸(TAT),少编码1个酪氨基;M4节段出现突变,含2个开放阅读框,编码2个非结构蛋白NS9和NS69.所有节段两端均含有6 bp保守的末端核苷酸序列5'-GUAAU/CU…UU/GCAUC-3';另除L1、M6节段外,其余9个节段均在编码区两侧发现5～9 bp的颠倒互补序列.GCRV-AH528与其他呼肠孤病毒核苷酸平均相似度在37.1％～98.1％之间;编码蛋白平均相似度在24.3％～98.3％之间.基于VP1蛋白的聚类分析结果显示,该病毒属于水生呼肠孤病毒属,在氨基酸水平上与典型株GCRV-873株的进化关系较远.本研究结果表明,该毒株为一株新的草鱼呼肠孤病毒Ⅱ型致病株.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	侯冠军	安徽省农业科学院水产研究所	103	286	8.0	13.0
2	李海洋	安徽省农业科学院水产研究所	82	367	10.0	15.0
3	江河	安徽省农业科学院水产研究所	93	401	12.0	16.0
4	何吉祥	安徽省农业科学院水产研究所	67	236	9.0	12.0
5	吴明林	安徽省农业科学院水产研究所	23	61	5.0	6.0
6	蒋阳阳	安徽省农业科学院水产研究所	19	70	4.0	7.0