基于荧光标记的紫娟茶树转录组EST-SSR标记开发

• 作者: 徐丕忠 李朝云 田易萍 邓少春 陈春林 陈林波
• 来源期刊: 江苏农业学报
• 学科: 农学
• 关键词: 茶树 转录组 SSR 荧光标记
• 年，卷（期）: 2018,（4）
• 所属期刊栏目: 遗传育种·生理生化
• 页码范围: 747-753
• 页数: 7页
• 分类号: S571.1
• 字数: 3152字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-4440.2018.04.005

摘要

为开发紫娟茶树转录组EST-SSR标记,基于前期对紫娟茶树芽、第2叶、开面叶、成熟叶转录组高通量测序所得到的242757条Unigene进行多态性分析与评价,再利用荧光标记PCR技术,规模化开发茶树EST-SSR标记.结果表明:从紫娟茶树转录组中搜索得到46041条Unigene含有57976个SSR位点,出现频率为23.88％.EST-SSR类型以一核苷酸、二核苷酸、三核苷酸重复为主,占总SSR的98.54％.设计合成138对荧光SSR引物,采用荧光标记PCR技术对4个差异较大的茶树品种进行引物筛选,其中44对引物得到高质量的EST-SSR标记位点.这些EST-SSR可用于茶树遗传多样性分析、分子育种等.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李朝云		1	3	1.0	1.0