鹰嘴豆NF-Y基因家族的全基因组序列鉴定及生物信息学分析

• 作者: 于月华 倪志勇 滕露
• 来源期刊: 河南农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 鹰嘴豆 NF-Y基因家族 全基因组鉴定 进化分析
• 年，卷（期）: 2018,（10）
• 所属期刊栏目: 作物栽培·遗传育种
• 页码范围: 38-44,63
• 页数: 8页
• 分类号: S529
• 字数: 4139字
• 语种: 中文
• DOI: 10.15933/j.cnki.1004-3268.2018.10.007

摘要

为了揭示鹰嘴豆NF-Y基因家族的功能,从鹰嘴豆全基因组中鉴定NF-Y基因,并利用生物信息学分析软件对其进行系统发育进化、染色体定位、基因结构、保守结构域以及microRNA的靶位点预测分析.结果表明,共鉴定出41个鹰嘴豆NF-Y基因家族成员,在进化上分为3个亚家族:CarNF-YA(8个)、CarNF-YB(22个)和CarNF-YC(11个);这些基因分布于7条(Ca1-Ca7)染色体上,另外还有3条序列未定位到染色体上.鹰嘴豆NF-Y家族基因序列大部分都含有1～5个内含子和1～6个外显子,少数序列如CarNF-YB9和CarNF-YC6等仅含有外显子结构;编码的蛋白质中共发现3个保守基序(Motif1、Motif2和Motif3),其中Motif1、Motif2在CarNF-YB和CarNF-YC亚家族中均有分布,而Motif3仅分布在CarNF-YA亚家族中.鹰嘴豆和拟南芥NF-Y蛋白家族成员系统进化树表明,Car/AtNF-YA可以分成6类,分别由6、1、3、3、1、4种蛋白质组成;Car/AtNF-YB可以分成4类,分别由21、8、2、4种蛋白质组成;Car/AtNF-YC亚基可以分成3类,分别由17、4、4个蛋白质组成.对鹰嘴豆NF-Y基因家族成员的miRNA169靶位点预测发现,41个成员中仅有CarNF-YA亚家族中的6个成员受到miRNA169调控.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	倪志勇	新疆农业大学农学院	59	287	9.0	14.0
2	于月华	新疆农业大学农学院	41	88	6.0	8.0
3	滕露	新疆农业大学农学院	3	2	1.0	1.0