巨桉EXP基因家族的生物信息学分析

• 作者: 刘果 詹妮 谢耀坚 陈鸿鹏
• 来源期刊: 林业科学研究
• 关键词: 巨桉 EXP基因 生物信息学分析 表达模式
• 年，卷（期）: 2018,（6）
• 页码范围: 39-46
• 页数: 8页
• 分类号: S718.46
• 语种: 中文
• DOI: 10.13275/j.cnki.lykxyj.2018.06.006

摘要

[目的]本研究有助于了解EXP基因家族的基本特征,为深入研究其功能搭建平台.[方法]本研究对从巨桉(Eucalyptus grandis Hill)中筛选出35个EXP基因家族成员(EgrEXP1～EgrEXP35),利用生物信息学方法对其基因特征与表达模式进行综合分析.[结果]巨桉EXP基因分布在8条染色体之上,EXP蛋白均定位在细胞质膜上发挥作用,大多数的家族成员具有信号肽.巨桉EXP编码的蛋白质由α-螺旋、延伸链、无规卷曲、β-转角组成.进化分析结果表明,巨桉EXP蛋白与毛果杨(Populus trichocarpa)EXP蛋白的进化关系接近.35个巨桉EXP基因在巨桉未成熟木质部、成熟叶片、韧皮部、茎尖、木质部以及幼叶组织中表达模式存在显著差异.[结论] EXP基因家族各成员的表达模式不同,EgrEXP17、EgrEXP18可能在巨桉木材形成过程中起重要作用.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	谢耀坚	国家林业局桉树研究开发中心	130	1807	22.0	36.0
2	刘果	国家林业局桉树研究开发中心	24	75	5.0	8.0
3	詹妮	国家林业局桉树研究开发中心	8	1	1.0	1.0
4	陈鸿鹏	国家林业局桉树研究开发中心	28	84	5.0	7.0