毛果杨CBF/DREB1基因家族生物信息学分析

• 作者: 丁咚 崔进荣 张杰伟 张玉红 陈亚娟 魏建华
• 来源期刊: 西南农业学报
• 学科: 农学
• 关键词: 杨树 CBF/DREB1 基因家族 进化分析
• 年，卷（期）: 2018,（3）
• 所属期刊栏目: 作物遗传育种·种质资源
• 页码范围: 457-461
• 页数: 5页
• 分类号: Q945.78|S601
• 字数: 3743字
• 语种: 中文
• DOI: 10.16213/j.cnki.scjas.2018.3.005

摘要

[目的]为了对毛果杨CBF基因家族进行系统分析,利用毛果杨基因组数据库,通过生物信息学的方法,鉴定毛果杨CBF基因家族的染色体定位、编码蛋白和磷酸化位点预测.[方法]通过序列比对进行进化和分类分析.[结果]毛果杨含有6个CBF基因,均不含内显子,分布于毛果杨的5条染色体上.[结论]MEME保守基序分析显示,杨树CBF蛋白均含有2个保守的基序,他们共同构成AP2结构域.磷酸化位点预测分析表明毛果杨CBF蛋白均含有大量的磷酸化位点.以上结果将为今后揭示毛果杨CBF蛋白的功能提供重要的线索.