基于家蚕中肠RNA-seq数据的新基因发掘及初步分析

• 作者: 周凯月 唐健 徐安英 李玉霞 郝长富
• 来源期刊: 安徽农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 转录组测序 新基因 序列比对 功能分析
• 年，卷（期）: 2018,（24）
• 所属期刊栏目: 动物科学·生物技术
• 页码范围: 60-64
• 页数: 5页
• 分类号: S881.2+6
• 字数: 4125字
• 语种: 中文

摘要

对前期获得的家蚕中肠组织转录组数据进行进一步生物信息学分析,利用Cufflinks软件对Mapped Reads进行组装,并与参考基因组注释信息进行比对,共发掘新基因788个.利用Blast软件将发掘的新基因与NR,Swiss-Prot数据库比对,其中746个新基因得到功能注释.这些新发掘基因在家蚕28个连锁群上都有分布,其中在第15连锁群上最多.有198个新基因注释到KEGG数据库中,分布于85条已知的通路中,将新基因与COG数据进行比对,并进行功能注释与分类,总共有258个新基因得到了注释,被分为22个COG类别,部分新基因的克隆分析,与预期结果一致,这些发现为以后进一步研究新基因的功能提供了基础信息.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	徐安英	江苏科技大学生物技术学院	47	385	13.0	17.0
3	周凯月	江苏科技大学生物技术学院	2	1	1.0	1.0
4	唐健	江苏科技大学生物技术学院	2	1	1.0	1.0
5	李玉霞	江苏科技大学生物技术学院	3	1	1.0	1.0
6	郝长富	江苏科技大学生物技术学院	3	1	1.0	1.0