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毛薯硒代半胱氨酸甲基转移酶SMT基因的克隆与表达分析
毛薯硒代半胱氨酸甲基转移酶SMT基因的克隆与表达分析
作者:
吴文嫱
夏薇
杨亚飞
符晓
黄东益
黎丹
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
毛薯
硒代半胱氨酸甲基转移酶
基因克隆
生物信息学
表达分析
摘要:
硒代半胱氨酸甲基转移酶(SMT,Selenocysteine methyltransferase)是植物硒代谢的关键酶,在植物硒积累的过程中发挥着重要作用.为了探究毛薯中SMT基因的功能,本研究以优质富硒毛薯Ds148为研究对象,利用RT-PCR技术从中克隆到了毛薯SMT基因,命名为DsSMT.DsSMT(登录号:MH046782)包含1038 bp完整开放阅读框(ORF),预测编码345个氨基酸,理论分子量(Mw)为37.24kD,等电点(pI)为5.01,编码的蛋白与其他植物的SMT蛋白同源性较高,具有较高的保守性.系统进化树分析显示,毛薯与海枣和菠萝的SMT蛋白的亲缘关系较近,聚为同一类.利用PSORTⅡ在线软件对DsSMT蛋白进行预测,结果表明其可能定位于细胞质中.实时荧光定量PCR分析显示,DsSMT基因在毛薯生长发育的各个时期的根、茎、叶、块茎以及块茎的皮组织中均有所表达,其中在毛薯的根和成熟期表达量最高.本研究从毛薯中克隆出了硒代谢相关酶DsSMT基因的cDNA序列,并对其进行了生物信息学分析;同时又对DsSMT基因在毛薯块茎形成的不同时期、不同组织中的表达情况进行相对定量的研究和分析,为深入研究DsSMT基因的调控机理提供分子依据,同时也为毛薯硒吸收、同化的分子机理研究奠定基础.
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硒半胱氨酸甲基转移酶
基因
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内容分析
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篇名
毛薯硒代半胱氨酸甲基转移酶SMT基因的克隆与表达分析
来源期刊
植物遗传资源学报
学科
关键词
毛薯
硒代半胱氨酸甲基转移酶
基因克隆
生物信息学
表达分析
年,卷(期)
2019,(4)
所属期刊栏目
研究简报
研究方向
页码范围
1087-1092
页数
6页
分类号
字数
语种
中文
DOI
10.13430/j.cnki.jpgr.20181027002
五维指标
作者信息
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姓名
单位
发文数
被引次数
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G指数
1
黄东益
海南大学热带农林学院
77
655
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2
吴文嫱
海南大学热带农林学院
24
63
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杨亚飞
海南大学热带农林学院
5
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夏薇
海南大学热带农林学院
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黎丹
海南大学热带农林学院
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海南大学热带农林学院
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期刊影响力
植物遗传资源学报
主办单位:
中国农业科学院作物科学研究所
中国农学会
出版周期:
双月刊
ISSN:
1672-1810
CN:
11-4996/S
开本:
大16开
出版地:
北京市中关村南大街12号
邮发代号:
82-643
创刊时间:
2000
语种:
chi
出版文献量(篇)
2803
总下载数(次)
3
总被引数(次)
34934
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