基于生物信息学途径探索与高原低氧心肌损伤相关微小RNA

• 作者: 冯振龙 崔庆华 施冰 李俊峡
• 来源期刊: 中国循证心血管医学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 高原 低压低氧 心肌损伤 高通量测序 微小RNA 大鼠
• 年，卷（期）: 2019,（4）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 423-427
• 页数: 5页
• 分类号: R542.2
• 字数: 4746字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1674-4055.2019.04.10

摘要

目的 通过高通量测序,筛选与高原低氧心肌损伤相关miRNA,为评估高原低氧心肌损伤提供新方法.方法 首先选取雄性6周龄SD大鼠置于实验舱模拟海拔7000 m环境下饲养,随机将大鼠分为低氧3 d、7 d、14 d和28 d组及常压常氧对照组,每组12只,记录大鼠呼吸频率及血氧饱和度.超声心动图评估大鼠心脏结构及功能.根据超声心动图和心肌组织病理,进一步选取高原低氧7 d组及对照组大鼠心肌组织,进行miRNA表达谱高通量测序,筛选差异表达miRNA.应用生物信息学方法,对差异表达miRNA进行GO功能和KEGG信号通路富集分析.选取5个显著差异表达miRNA,应用荧光定量PCR法,检测其在低压低氧暴露后不同时间点大鼠心肌和血浆表达变化.结果 成功构建大鼠高原低氧心肌损伤模型.与对照组比较,低氧暴露7 d大鼠左心室收缩和舒张功能显著下降(P＜0.05).心肌细胞出现肿胀、肌浆凝聚.高通量测序结果提示,与对照组比较,低氧暴露7 d大鼠心肌组织中18个miRNA表达发生显著变化.其中15个miRNA表达上调,3个miRNA表达下调.差异表达miRNA功能主要富集在氧化应激、细胞凋亡、自噬、细胞增殖、炎症等方面.PCR结果提示,随着低氧暴露时间延长,大鼠血浆中miR-144-3p表达水平显著升高.结论 高原低氧环境可造成大鼠心脏收缩和舒张功能受损.血浆miR-144-3p可能成为评估高原低压低氧心肌损伤的新的生物标志物.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李俊峡	中国人民解放军总医院第七医学中心	20	48	4.0	6.0
2	崔庆华	北京大学医学部生物信息学系	10	36	4.0	6.0
3	施冰	中国人民解放军总医院第七医学中心	3	1	1.0	1.0
4	冯振龙	安徽医科大学研究生院	3	1	1.0	1.0