布鲁菌疫苗株A19全基因组测序及功能分析

• 作者: 呼和巴特尔 孙珂 王姝懿 王文龙 赵学亮
• 来源期刊: 中国兽医学报
• 学科: 农学
• 关键词: 布鲁菌 布鲁菌疫苗株A19 全基因组测序 功能分析
• 年，卷（期）: 2019,（9）
• 所属期刊栏目: 人兽共患病
• 页码范围: 1770-1775
• 页数: 6页
• 分类号: S852.61|S855.9
• 语种: 中文
• DOI: 10.16303/j.cnki.1005-4545.2019.09.18

摘要

采用Illumina Hiseq和PacBio测序技术对布鲁菌A19进行全基因组测序,并进行GO注释、VFDB注释、ARDB注释、CRISPR以及基因岛预测等生物信息学分析.结果 显示:A19全基因组大小为3.28 Mb,GC含量分布未见异常,含1个CRISPR和16个基因岛,通过GO数据库注释发现,参与生物学途径的基因5 311个、细胞组份基因有3 350个、分子功能基因有3 078个;通过VFDB注释发现,与毒力相关的基因82个,主要包括脂多糖(LPS)、纤连结合蛋白、virB四型分泌系统等毒力相关因子;通过ARDB数据库注释发现,与耐药相关的基因1个,该基因的表达产物通过影响焦磷酸异构酶的表达,从而产生对抗生素的耐药.本试验通过A19全基因组测序,为布鲁菌病的治疗和致病机制的研究及疫苗的开发奠定了基础.