基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取       
摘要:
[目的]采用生物信息学方法分析双歧杆菌BB12菌株的Sec途径分泌系统及预测底物蛋白.[方法]以双歧杆菌BB12菌株基因组注释的蛋白氨基酸序列为研究对象,在NCBI中以Fasta形式下载,采用一系列生物信息学软件分析该基因组中Sec分泌途径及底物蛋白行使的功能,同时采用COG功能数据库对这些蛋白进行功能注释和聚类分析.[结果]通过分析发现双歧杆菌BB12菌株Sec分泌途径相关的蛋白基因共有9个,其中5个是Sec分泌途径构建蛋白基因,2个信号肽酶识别基因,1个脂蛋白信号肽识别基因和1个信号肽识别蛋白编码基因.Sec底物蛋白分析发现该菌共含1583个蛋白,经过Sec分泌途径到细胞外的蛋白有57个,35个具有COG功能,占61%,其中被Spase I型信号肽酶识别的有37个,被SpaseⅡ型信号肽酶识别的有20个.[结论]COG功能注释显示一些蛋白没有功能,有功能的蛋白主要与氨基酸运输和代谢、碳水化合物的运输和代谢、功能细胞壁/膜和无机离子运输和代谢功能有关.
推荐文章
青春双歧杆菌ATCC15703I型Sec途径分泌蛋白的预测和功能分析
青春双歧杆菌
基因组
分泌蛋白
Sec分泌途径
信号肽
亚硝化单胞菌is79a3 Sec途径分泌系统及底物蛋白分析
亚硝化单胞菌
分泌蛋白
分泌途径
功能分析
双歧杆菌BB12胞外多糖发酵条件优化及抗氧化活性研究
双歧杆菌BB12
胞外多糖
自由基清除
抗氧化活性
内容分析
关键词云
关键词热度
相关文献总数  
(/次)
(/年)
文献信息
篇名 双歧杆菌BB12菌株Sec分泌途径及底物蛋白分析
来源期刊 安徽农业科学 学科 工学
关键词 双歧杆菌BB12 基因组 分泌蛋白 功能分析
年,卷(期) 2019,(19) 所属期刊栏目 食品科学·药用生物
研究方向 页码范围 175-177
页数 3页 分类号 TS201
字数 2806字 语种 中文
DOI 10.3969/j.issn.0517-6611.2019.19.051
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 朱德全 佳木斯大学理学院 65 156 7.0 9.0
2 张路路 佳木斯大学理学院 9 5 1.0 1.0
3 张百惠 佳木斯大学理学院 2 0 0.0 0.0
4 岳旭升 佳木斯大学理学院 1 0 0.0 0.0
5 暮雪 佳木斯大学生命科学学院 1 0 0.0 0.0
6 吴天 佳木斯大学理学院 1 0 0.0 0.0
传播情况
(/次)
(/年)
引文网络
引文网络
二级参考文献  (49)
共引文献  (17)
参考文献  (9)
节点文献
引证文献  (0)
同被引文献  (0)
二级引证文献  (0)
1950(1)
  • 参考文献(1)
  • 二级参考文献(0)
1994(1)
  • 参考文献(0)
  • 二级参考文献(1)
1996(2)
  • 参考文献(0)
  • 二级参考文献(2)
1997(1)
  • 参考文献(1)
  • 二级参考文献(0)
1998(1)
  • 参考文献(0)
  • 二级参考文献(1)
1999(2)
  • 参考文献(0)
  • 二级参考文献(2)
2000(7)
  • 参考文献(0)
  • 二级参考文献(7)
2001(6)
  • 参考文献(0)
  • 二级参考文献(6)
2002(1)
  • 参考文献(0)
  • 二级参考文献(1)
2003(2)
  • 参考文献(0)
  • 二级参考文献(2)
2004(3)
  • 参考文献(0)
  • 二级参考文献(3)
2005(7)
  • 参考文献(1)
  • 二级参考文献(6)
2006(4)
  • 参考文献(0)
  • 二级参考文献(4)
2007(3)
  • 参考文献(1)
  • 二级参考文献(2)
2008(3)
  • 参考文献(0)
  • 二级参考文献(3)
2009(3)
  • 参考文献(0)
  • 二级参考文献(3)
2010(3)
  • 参考文献(1)
  • 二级参考文献(2)
2011(3)
  • 参考文献(2)
  • 二级参考文献(1)
2012(3)
  • 参考文献(0)
  • 二级参考文献(3)
2013(1)
  • 参考文献(1)
  • 二级参考文献(0)
2017(1)
  • 参考文献(1)
  • 二级参考文献(0)
2019(0)
  • 参考文献(0)
  • 二级参考文献(0)
  • 引证文献(0)
  • 二级引证文献(0)
研究主题发展历程
节点文献
双歧杆菌BB12
基因组
分泌蛋白
功能分析
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
安徽农业科学
半月刊
0517-6611
34-1076/S
大16开
安徽省合肥市农科南路40号
26-20
1961
chi
出版文献量(篇)
78281
总下载数(次)
236
总被引数(次)
436536
  • 期刊分类
  • 期刊(年)
  • 期刊(期)
  • 期刊推荐
论文1v1指导