基于转录组测序分析NaCl胁迫下新疆野苹果叶和根糖酵解相关基因的表达

• 作者: 何晨晨 刘俐君 鲁晓燕
• 来源期刊: 果树学报
• 学科: 农学
• 关键词: 新疆野苹果 NaCl胁迫 转录组测序 糖酵解
• 年，卷（期）: 2020,（7）
• 所属期刊栏目: 种质资源·遗传育种·分子生物学
• 页码范围: 951-961
• 页数: 11页
• 分类号: S661.1
• 字数: 6708字
• 语种: 中文
• DOI: 10.13925/j.cnki.gsxb.20200037

摘要

[目的]筛选新疆野苹果响应NaCl胁迫相关基因.[方法]以新疆野苹果组培苗为试验材料,对150 mmol· L-1NaCl处理48 h后的新疆野苹果幼苗叶片及根系进行转录组测序.[结果]与对照相比,NaCl处理48 h时,新疆野苹果幼苗叶片中差异表达基因为3 364个,其中1 745个DEGs在盐胁迫响应中上调表达,1 619个DEGs下调表达;根系中差异表达基因为3 808个,其中1 057个DEGs在盐胁迫响应中上调表达,2 751个DEGs下调表达.新疆野苹果叶片和根系中所共有的差异基因有2 095个得到注释,这些基因共涉及44个Pathway,富集最显著的Pathway主要有糖酵解/糖异生、磷酸戊糖途径、果糖和甘露糖代谢、丙酮酸代谢等.[结论]通过转录组测序和qRT-PCR验证发现,新疆野苹果受到NaCl胁迫后,在糖酵解过程中TPI、FBPase、pckA、PPDK等基因表达量发生明显变化,说明糖酵解途径在新疆野苹果应答NaCl胁迫过程中起着一定的作用.