伯乐树叶绿体密码子役佣偏好分析

• 作者: 李佳灵 尹为治 方正 黄良鸿
• 来源期刊: 甘肃林业科技
• 关键词: 伯乐树 叶绿体 基因 密码子偏好 最优密码子
• 年，卷（期）: 2020,（4）
• 页码范围: 1-7
• 页数: 7页
• 分类号: Q343.3+5
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1006-0960.2020.04.001

摘要

以伯乐树叶绿体基因为研究对象,利用CodonW、SPSS、R等软件分析密码子役佣模式.结果表明,伯乐树叶绿体基因多数现役密码子偏好较弱,现役密码子偏好数与第3位GC含量相关性均未达显著水平;单个基因现役密码子数比值多为-0.05～0.10;对应分析中第1轴与现役密码子偏好数、密码子GC总含量、密码子第3位GC含量的相关系数分别为―0.208、-0.013、-0.064,均未发现显著相关性;密码子第3位偏向于使用嘧啶;确定16个最优密码子,其中多以A或T结尾.伯乐树叶绿体基因密码子役佣模式可能由选择和突变及其它因素共同作用形成.此外,为便于论述定义了几个基本术语并以数学语言改写了有效密码子数公式.