卡波西肉瘤病毒编码的kshv-miR-K12-1-5 p靶基因预测及生物信息学分析

• 作者: 张慧 普雄明 龚海波
• 来源期刊: 肿瘤预防与治疗
• 学科: 医学
• 关键词: 卡波西肉瘤病毒 MiRNA KSHV-miR-K12-1-5p 生物信息学分析
• 年，卷（期）: 2020,（12）
• 所属期刊栏目: 皮肤肿瘤学专栏?临床研究
• 页码范围: 916-922
• 页数: 7页
• 分类号: R739.5|R730.7
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1674-0904.2020.12.002

摘要

目的:对卡波西肉瘤病毒(Kaposi's sarcoma-associated herpesvirus,KSHV)编码的小分子RNA kshv-miR-K12-1-5p进行靶基因预测和靶基因生物信息学分析,为未来对kshv-miR-K12-1-5p靶基因的研究提供可行的方向.方法:利用数据库PubMed、miRTarBase、TargetScanHuman Custom、miRDB等对kshv-miR-K12-1-5p靶基因进行查询和预测,之后对这些靶基因进行GO和KE GG的富集分析以及蛋白互作网络的分析,并对互作网络的关键模块和关键基因进行提取和分析.结果:通过数据库miRTarBase查询到经过验证的靶基因有NF-Kappa-B抑制因子α和细胞转录因子MAF;通过PubMed查询到经过验证的靶基因有抑制细胞因子信号转导6.通过生物信息学分析预测得到8个靶基因,分别是PPIH、POLR2B、HNRNPU、MAGOHB、DNAJC8、HNRNPC、RBM22、HNRNPA3.结论:本次研究通过利用生物信息学的方法,对KSHV编码的kshv-miR-K12-1-5p靶基因进行预测,得到一些kshv-miR-K12-1-5p可能作用的靶点,为未来研究者提供可能的研究方向.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	普雄明		294	781	11.0	15.0
2	张慧		37	69	4.0	7.0
3	龚海波		1	0	0.0	0.0