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基于生物信息学分析CISD2在肝细胞癌中的表达意义及功能网络关系
基于生物信息学分析CISD2在肝细胞癌中的表达意义及功能网络关系
作者:
侯婉云
刘发煇
朱丽兰
罗春英
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
CISD2
肝细胞癌
生物信息学
预后
功能网络分析
摘要:
目的 探究CDGSH铁硫结构域2(CISD2)在肝细胞癌(HCC)发生发展中的作用、临床病理意义及其潜在作用机制.方法 Kaplan Meier-plotter分析CISD2 mRNA表达与HCC患者5年生存率的关系;在线网页工具STRING构建CISD2蛋白相互作用网络,基因本体论富集分析CISD2蛋白质功能;网页工具TIMER分析CISD2在HCC中与免疫细胞浸润含量之间的关系;GSEA分析CISD2高表达在HCC中参与的信号通路.结果 (1)CISD2mRNA高表达的HCC患者的5年总生存率低于低表达患者;(2) CISD2与B细胞、CD4+T细胞、CD8+T细胞、巨噬细胞和树突状细胞的浸润呈负相关;(3) CISD2主要参与了细胞内二价铁硫簇结合,铁硫簇绑定以及金属集群绑定;(4) GSEA分析表明CISD2高表达在HCC中促进卟啉和叶绿素代谢,戊糖、葡萄糖醛酸转换,抗坏血酸和醛酸代谢,氨基糖和核苷酸糖代谢,淀粉和蔗糖代谢等多条代谢通路.结论 (1)在HCC中,CISD2 mRNA高表达与HCC患者的较差预后有关.(2) CISD2可能通过影响肿瘤细胞的铁离子、能量代谢和肿瘤免疫微环境促进肿瘤细胞的生存和增殖.
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文献信息
篇名
基于生物信息学分析CISD2在肝细胞癌中的表达意义及功能网络关系
来源期刊
右江医学
学科
医学
关键词
CISD2
肝细胞癌
生物信息学
预后
功能网络分析
年,卷(期)
2020,(6)
所属期刊栏目
论著·基础研究
研究方向
页码范围
415-420
页数
6页
分类号
R735.7
字数
4225字
语种
中文
DOI
10.3969/j.issn.1003-1383.2020.06.003
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
罗春英
右江民族医学院附属医院病理科
40
134
6.0
9.0
5
刘发煇
右江民族医学院附属医院病理科
2
1
1.0
1.0
6
侯婉云
右江民族医学院附属医院病理科
1
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朱丽兰
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肝细胞癌
生物信息学
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研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
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期刊影响力
右江医学
主办单位:
右江民族医学院附属医院
出版周期:
双月刊
ISSN:
1003-1383
CN:
45-1126/R
开本:
大16开
出版地:
广西百色市中山二路18号右江民族医学院附属医院院内
邮发代号:
创刊时间:
1972
语种:
chi
出版文献量(篇)
7581
总下载数(次)
2
总被引数(次)
17927
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