茶树CsBBX基因家族的鉴定与表达

• 作者: 叶一隽 李佳敏 曹红利 李远华 岳川
• 来源期刊: 应用与环境生物学报
• 关键词: 茶树 BBX基因家族 锌指蛋白 逆境胁迫 基因表达
• 年，卷（期）: 2020,（6）
• 页码范围: 1508-1516
• 页数: 9页
• 语种: 中文
• DOI: 10.19675/j.cnki.1006-687x.2020.07003

摘要

锌指蛋白是一类含有"手指状"结构域的蛋白质,其中B-BOX(BBX)蛋白在植物的生长发育及逆境胁迫响应中具有重要的作用.利用生物信息学方法,从茶树基因组中鉴定出31个CsBBX基因,全面分析其生物信息学特征,同时分析它们在干旱、盐胁迫和MeJA处理中的转录组数据.结果显示,CsBBX基因大小差异较大,开放阅读框在324-1 746 bp之间,编码氨基酸长在107-581 aa之间.CsBBX的编码蛋白序列中含有保守的BOX1(B1)、BOX2(B2)和CCT结构域,可以分为B1B2+CCT(Ⅰ和Ⅱ)、B1+CCT(Ⅲ)、B1+B2(Ⅳ)和B1(V)等5种类型.启动子顺式作用元件预测显示,CsBBX基因启动子中含有多种光响应元件,同时还富含多种与植物生长发育及逆境胁迫响应相关的顺式作用元件.CsBBX基因在叶片组织中具有较高的表达水平,且部分基因随着叶片成熟度的增加转录水平升高.干旱和盐胁迫条件下,大部分CsBBX基因的表达受抑制,而部分基因被诱导表达;大部分CsBBX基因的表达受MeJA诱导.因此推测CsBBX基因在茶树生长发育及抗逆响应中发挥了重要的功能.