茶树SRO基因家族的鉴定及表达分析

• 作者: 叶乃兴 王鹏杰 郑玉成 郭永春 陈笛 陈雪津
• 来源期刊: 茶叶科学
• 学科: 农学
• 关键词: 茶树 SRO 系统进化 干旱胁迫
• 年，卷（期）: 2019,（4）
• 页码范围: 392-402
• 页数: 11页
• 分类号: S571.1|S154.1
• 字数: 6160字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-369X.2019.04.004

摘要

SROs(Similar to rcd one)是植物特有的基因家族.本研究利用生物信息学方法从茶树基因组中鉴定获得9个茶树SRO基因家族成员,分别命名为CsRCD1—4和CsSRO1—5.9个茶树SRO基因的编码蛋白均具有特征结构域PARP和RST,具有相似的保守基序.系统进化树分析聚分为3组,I组包含CsRCD1—4,Ⅱ组包含 CsSRO1 和 CsSRO2,Ⅲ组包含 CsSRO3—5.基因结构分析表明每个CsSRO基因含有 4 至 9 个外显子.8个茶树组织转录组数据分析表明,CsRCD1、CsRCD3和CsRCD4可能在茶树不同发育阶段具有重要作用;大多数CsSRO基因在根和成熟叶中较高表达.上游启动子区域分析发现大量与植物发育、激素及胁迫响应密切相关的顺式作用元件,进一步对CsSRO基因在干旱和脱落酸处理下的表达模式进行分析发现,9个CsSRO基因均被诱导表达,CsSRO基因可能与茶树抗旱密切相关.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	叶乃兴	福建农林大学园艺学院/茶学福建省高校重点实验室	88	846	16.0	25.0