基于转录组测序的西瓜果肉硬度相关基因表达分析

• 作者: 张超 时月 王雪敏 赵晓燕 郑雪梦 马越
• 来源期刊: 中国瓜菜
• 学科: 农学
• 关键词: 西瓜 硬度 转录组 差异表达基因
• 年，卷（期）: 2020,（10）
• 所属期刊栏目: 试验研究
• 页码范围: 15-22
• 页数: 8页
• 分类号: S651
• 语种: 中文

摘要

以脆肉型'京欣3号'西瓜和硬肉型'甜王'西瓜为样品,评价果肉硬度表型差异,并利用转录组测序技术检测2个品种间差异表达基因.结果发现,'甜王'西瓜品种果肉硬度是'京欣3号'西瓜的1.9倍,表型与'京欣3号'西瓜具有显著性差异.转录组测序结果显示,与'京欣3号'西瓜相比,'甜王'西瓜样品有5342个基因差异表达,其中2360个基因上调表达,2982个基因下调表达.差异基因主要注释在碳水化合物代谢、信号转导、脂质代谢等途径,其中与果肉硬度变化的候选基因主要包括果胶酯酶、果胶裂合酶、聚半乳糖醛酸酶、纤维素酶、纤维素合酶、β-半乳糖苷酶、β-葡萄糖苷酶、酸性几丁质酶、几丁质酶、木葡聚糖内转葡糖基酶/水解酶和脂氧合酶基因.钙调蛋白、乙烯反应转录因子、乙烯不敏感样蛋白、WRKY转录因子、MYC2转录因子、过氧化氢酶、呼吸爆发氧化酶和脱落酸受体PYR1参与果肉细胞活动信号转导,可能与果肉硬度相关.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王雪敏		17	63	5.0	7.0
2	张超		12	15	2.0	3.0
3	郑雪梦		1	0	0.0	0.0
4	时月		1	0	0.0	0.0
5	马越		1	0	0.0	0.0
6	赵晓燕		1	0	0.0	0.0