生鲜畜禽肉中沙门氏菌全基因组分析与分子溯源

• 作者: 严礼 宋晟 张海韵 王芳斌 郭焜鹏 高晗
• 来源期刊: 食品与机械
• 关键词: 沙门氏菌 全基因组测序 系统进化树 分子溯源研究
• 年，卷（期）: 2020,（9）
• 所属期刊栏目: 安全与检测
• 页码范围: 55-62,169
• 页数: 9页
• 语种: 中文
• DOI: 10.13652/j.issn.1003-5788.2020.09.009

摘要

依据GB 47894.—2016对从长沙市生鲜市场随机采集的生鲜猪肉、鸡肉进行检验.结果显示:有20份生鲜猪肉样品检出沙门氏菌,检出率为83.3％;有20份生鲜鸡肉样品检出沙门氏菌,检出率为74.1％;总检出率为784.％.通过对其中40株沙门氏菌进行全基因组测序与分子溯源研究,结果表明:20株猪源性沙门氏菌与20株鸡源性沙门氏菌按分子溯源分析可分为5个明显不同的聚类,清晰反映了沙门氏菌的污染源分布及交叉污染情况,实现了精准溯源;其中发现了15个致病基因,从基因层面阐明了沙门氏菌可能存在的致病基因与致病机制,提示了沙门氏菌潜在的致病风险;试验发现了15个耐药基因,从基因层面阐明了沙门氏菌可能存在的耐药基因与耐药机制.