茶树MYC基因家族生物信息学及其表达特性

• 作者: 曹丹 刘艳丽 马林龙 金孝芳
• 来源期刊: 湖南农业大学学报（自然科学版）
• 关键词: 茶树 髓细胞增生蛋白基因家族 生物信息学 基因表达 硒
• 年，卷（期）: 2021,（3）
• 所属期刊栏目: 生物科学与技术|Bioscience and Biotechnology
• 页码范围: 291-298
• 页数: 8页
• 分类号: Q786
• 语种: 中文
• DOI: 10.13331/j.cnki.jhau.2021.03.007

摘要

采用生物信息学方法对茶树髓细胞增生蛋白(myelocytomatosisproteins,MYCs)基因家族成员的理化性质、进化关系、蛋白质结构、顺式作用元件进行分析,运用qRT–PCR技术研究MYC基因家族成员在茶树中的表达.结果表明:茶树MYC为不稳定蛋白、亲水蛋白、非分泌蛋白、非跨膜蛋白,均呈酸性;MYC基因家族6个成员都定位于细胞核中;基因家族二级结构主要以无规则卷曲和α–螺旋为主,均含1个外显子,无内含子,motif分布相似的成员,其三级结构也相似;茶树MYC基因和拟南芥的亲缘关系更近;茶树MYC家族基因启动子均主要含有光信号、茉莉酸甲酯和脱落酸等3个顺式作用元件.qRT–PCR分析显示,MYC家族成员主要在茶树的根和种子中表达,可能在茶树对硒吸收累积过程中发挥调控作用.