ssc-miR-17-3p调控脂肪沉积的靶基因生物信息学分析

• 作者: 赵志显 邢凯 常雪蕊 齐晓龙 盛熙晖 倪和民 王相国 肖龙菲 王楚端 郭勇
• 来源期刊: 北京农学院学报
• 学科: 农学
• 关键词: ssc-miR-17-3p 脂肪沉积 靶基因预测 调控机制
• 年，卷（期）: 2021,（2）
• 所属期刊栏目: 生物学
• 页码范围: 6-10
• 页数: 5页
• 分类号: S813.3
• 语种: 中文
• DOI: 10.13473/j.cnki.issn.1002-3186.2021.0202

摘要

[目的]找到与猪脂肪沉积相关的候选靶基因,为ssc-miR-17-3p参与脂肪沉积调控机制研究提供相关理论依据. [方法]利用miRDB,miRWalk和TargetScan数据库获得了miRNA-17-3p候选靶基因;利用DAVID和KOBAS数据库对候选靶基因进行了KEGG/GO功能富集分析,并通过Cytoscape可视化工具构建了其可能参与的调控网络.[结果]结果表明,ssc-miR-17-3p候选靶基因TSTD2、CSDE1、SCGB1 D1、TEAD1、GPD2、NFATC3、MBNL1、PPP1R12B、CAMK2D、HBEGF、LRRC28、UBE2D4、MAP4与脂肪沉积有关.GPD2、CAMK2D、HBEGF等可能在催产素信号通路、MAPK信号通路、GnRH信号通路,以及脂质代谢、甘油磷脂代谢、糖醇代谢、大分子代谢,细胞代谢等过程发挥了作用.[结论]ssc-miR-17-3p可能通过调控多个靶基因,信号通路和生物过程影响脂肪的沉积与代谢,其功能有待进一步实验室试验验证.