苦荞CCT基因家族生物信息学及表达分析

• 作者: 石桃雄 赵佳利 田桃 陈庆富 邓娇
• 来源期刊: 广西科学
• 关键词: 苦荞 开花 FtCCT 系统进化 表达分析
• 年，卷（期）: 2021,（3）
• 所属期刊栏目: 特邀栏目|Special Columns
• 页码范围: 301-309
• 页数: 9页
• 分类号: S513
• 语种: 中文
• DOI: 10.13656/j.cnki.gxkx.20210830.007

摘要

CCT转录因子在调控植物花期、生长发育及抗非生物胁迫等方面发挥着重要的功能.本研究以拟南芥AtCCT基因家族为参考序列,利用本地BLAST并结合保守结构域等生物信息学工具,筛选出苦荞FtCCT基因家族成员,并对其理化性质、染色体分布、基因结构、系统进化及表达水平进行分析.结果显示:从苦荞中共鉴定出35个FtCCT基因,含1-8个内含子;编码蛋白有117-753个氨基酸残基,等电点为4.96-9.51,均为亲水性蛋白.染色体定位分析表明,这些基因在8条染色体上均有分布.苦荞FtCCT基因家族含有10个保守基序和5个保守结构域,且都含有CCT保守结构域.系统进化分析表明,苦荞的FtCCT基因家族与拟南芥一样可分为3个亚家族,其中CMF亚家族的成员最多.35个FtCCT基因在苦荞根、茎、叶和花中的表达水平具有差异性,在叶和花中具有高表达量的成员较多,只有少数的成员在根和茎中高表达.本研究为进一步解析CCT基因调控苦荞花期及生长发育奠定基础.