进口黄水仙基于RAD-Seq的SNP标记开发与分析

• 作者: 于文涛 张明哲 沈建国 袁向芬 尹文秀 吕继洲
• 来源期刊: 中国口岸科学技术
• 关键词: 黄水仙 简化基因组测序 单核苷酸多态性 分子鉴定 鳞球茎花卉
• 年，卷（期）: 2021,（4）
• 所属期刊栏目: 中国口岸科学技术|CHINA PORT SCIENCE AND TECHNOLIGY
• 页码范围: 10-16
• 页数: 7页
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1002-4689.2021.04.002

摘要

为对海量进口黄水仙鳞茎观赏花卉进行快速高精准鉴定,开发其特异性单核苷酸多态性分子标记位点,本研究通过对4种不同进口黄水仙品种和中国水仙共18个样品进行高通量简化基因组测序,得到进口黄水仙简化基因组信息;通过构建简化基因组文库和分子标记检测,得到简化基因组有效数据97.33 G,开发出群体单核苷酸多态性分子标记12532个;通过主成分分析和构建遗传关系邻接树分析,可高分辨率鉴定出所有参试水仙属鳞茎花卉品种.利用高通量简化基因组测序技术,可高效率、低成本地开发大量用于进口黄水仙鳞茎花卉精准鉴定的单核苷酸多态性分子标记,为海关在口岸执法把关提供技术支撑.