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基于转录组测序技术揭示salsolinol的神经毒性作用
基于转录组测序技术揭示salsolinol的神经毒性作用
作者:
张芳芳
李梓晗
高怿宣
王雨桐
冯予鑫
王佳楠
陈薛钗
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
salsolinol
转录组
差异表达基因
自噬
摘要:
Salsolinol(1-甲基-6,7-二羟基-1,2,3,4-四氢异喹啉,Sal)是一种儿茶酚异喹啉类化合物,由多巴胺和醛类物质催化生成,其在神经系统中的毒性作用机制仍不清楚.本文主要探究Sal对细胞转录组的影响揭示其神经毒性的调控机制.方法选用大鼠肾上腺嗜铬细胞瘤PC12细胞进行Sal诱导,采用转录组测序分析(RNA-Seq)建立全转录组图谱,对差异基因进行GO分析和KEGG分析,最后采用Western-blot进行验证.结果RNA-Seq分析Sal处理组和对照组的mRNA丰度差异,共鉴定出2405个显著性差异的表达基因(倍数变化≥2.0),包括740个上调基因,1665个下调基因.信号通路研究显示,这些基因与氧化应激、氧化磷酸化、自噬和溶酶体调节、PI3K-Akt信号通路、AMPK信号通路等密切相关,并发现Sal可以使Akt和mTOR蛋白的磷酸化水平增加.结论Sal激活Akt-mTOR信号通路来调控细胞内的自噬水平,从而引发神经毒性作用.
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文献信息
篇名
基于转录组测序技术揭示salsolinol的神经毒性作用
来源期刊
生命科学仪器
学科
生物学
关键词
salsolinol
转录组
差异表达基因
自噬
年,卷(期)
2021,(6)
所属期刊栏目
研究报告|Research report
研究方向
页码范围
29-34
页数
6页
分类号
Q189
字数
语种
中文
DOI
10.11967/2021191204
五维指标
传播情况
被引次数趋势
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(/年)
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引文网络
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共引文献
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2021(0)
参考文献(0)
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引证文献(0)
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研究主题发展历程
节点文献
salsolinol
转录组
差异表达基因
自噬
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
生命科学仪器
主办单位:
北京市北分仪器技术公司
出版周期:
双月刊
ISSN:
1671-7929
CN:
11-4846/TH
开本:
大16开
出版地:
北京市
邮发代号:
2-262
创刊时间:
2003
语种:
chi
出版文献量(篇)
2073
总下载数(次)
10
总被引数(次)
7810
相关基金
国家自然科学基金
英文译名:
the National Natural Science Foundation of China
官方网址:
http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:
青年科学基金项目(面上项目)
学科类型:
数理科学
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