菠萝MYB基因AcoMYB1的克隆与表达分析

• 作者: 李穆 蔡元保 杨祥燕 黄思婕 李季东 谭秦亮 邱文武 方位宽
• 来源期刊: 热带作物学报
• 关键词: 菠萝 MYB基因 基因表达 果实发育 逆境胁迫
• 年，卷（期）: 2021,（5）
• 所属期刊栏目: 组学与生物技术|Omics & Biotechnology
• 页码范围: 1209-1215
• 页数: 7页
• 分类号: S668.3
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-2561.2021.05.002

摘要

根据菠萝转录组的测序结果克隆到1个MYB转录因子基因,命名为AcoMYB1,GenBank登录号为XM_020230319.该基因cDNA全长1221 bp,开放阅读框(ORF)为747 bp,编码一个含有248个氨基酸的蛋白.序列分析表明,AcoMYB1氨基酸序列N端具有2个保守的SANT结构域,属于R2R3类MYB转录因子.生物信息学分析表明,AcoMYB1是不稳定的亲水蛋白,不具有跨膜结构和信号肽,可能定位于细胞质,二级结构以α-螺旋和无规则卷曲为主.实时荧光定量PCR分析表明,AcoMYB1在菠萝干旱、低温逆境胁迫处理下受诱导表达,整体上表现出"先升后降"的趋势;在早熟品种和晚熟品种的果实发育过程中也被诱导表达,表现为"升-降-升"的趋势,特别是在果实发育早期和果实成熟后期受诱导表达的强度较为突出.由此推测AcoMYB1作为正调控因子参与菠萝冷害、干旱逆境胁迫的响应过程,并在菠萝果实早期发育及后期成熟发挥调控作用.